Otegi ingresó en 1977 en ETA político-militar y a partir de 1981 formó parte de ETA militar. Detenido en Francia, fue entregado a España en 1987 y, tras cumplir una condena por secuestro, se pasó a la política.

Elegido diputado autonómico vasco en 1995, la condena en 1997 de los miembros de la Mesa Nacional de Herri Batasuna le encumbró a la dirección de la formación abertzale, de la que hoy sigue siendo referente.

13/7/1987.- Primer ingreso en prisión preventiva en España.

1/2/1989.- Absuelto por la Audiencia Nacional de la acusación de haber participado en el secuestro en 1979 del entonces diputado de UCD Javier Rupérez.

21/2/1989.- La Audiencia Nacional le condena a seis años de prisión por el secuestro en 1979 del director de la fábrica Michelín de Vitoria Luis Abaitua.

4/10/1990.- Absuelto en la causa por el secuestro -también en 1979- del diputado de UCD Gabriel Cisneros. Sale en libertad provisional.

11/9/1991.- Ingresa en prisión para terminar de cumplir la condena por el secuestro de Abaitua.

4/5/1993.- Sale en libertad definitiva.

1/4/2004.- El Tribunal Superior de Justicia del País Vasco (TSJPV) le condena a quince meses de prisión por enaltecimiento del terrorismo por su intervención tres años antes en el entierro de la presunta etarra Olaia Castresana.

23/3/2005.- El TSJPV le absuelve de la acusación de injurias graves al Rey al estimar que las declaraciones hechas el 26 de febrero de 2003, calificando a Don Juan Carlos de "responsable de los torturadores", estaban amparadas por la libertad de expresión.

25/5/2005.- El juez Fernando Grande-Marlaska ordena su ingreso en prisión -eludible bajo fianza de 400.000 euros- en el sumario en el que investiga la subordinación de Batasuna a la banda terrorista y la financiación de ésta a través de las "herriko tabernas". Dos días después, Otegi paga la fianza y abandona la cárcel.

2/6/2005.- Grande-Marlaska procesa a Otegi por integración en ETA en la causa de las "herriko tabernas".

4/11/2005.- El Tribunal Supremo (TS) revoca la sentencia anterior del TSJPV y le condena a un año de prisión por injurias graves al Rey, al considerar que sus palabras afectaban al "núcleo último"de la dignidad del jefe del Estado.

18/1/2006.- El TS anula la sentencia del TSJPV que le condenó por su intervención en el entierro de Olaia Castresana y ordena repetir el juicio.

29/3/2006.- Grande-Marlaska ordena su ingreso en prisión, eludible bajo fianza de 250.000 euros, al considerarle "inductor"de los actos violentos ocurridos durante la jornada de huelga convocada veinte días antes en el País Vasco y Navarra por la muerte de dos presos etarras.

7/4/2006.- Sale de prisión tras abonar la fianza.

27/4/2006.- La Audiencia Nacional le condena a quince meses de prisión por enaltecimiento del terrorismo por su participación "activa"en un homenaje al etarra José Miguel Beñarán, "Argala", en diciembre de 2003.

21/3/2007.- La Audiencia Nacional -que volvía a juzgarle por el homenaje a Olaia Castresana- se ve obligada a absolverle, a pesar de considerar que había "prueba de cargo suficiente"para su condena, después de que la Fiscalía retirara la acusación contra él.

8/6/2007.- Es detenido por la Policía e ingresa en prisión para cumplir la sentencia por el homenaje a "Argala".

5/12/2007.- La Audiencia Nacional archiva la causa en la que le había imputado por participar en 2003 en Bilbao en un homenaje al presunto etarra Arkaitz Otazua, muerto en un enfrentamiento con la Ertzaintza.

30/8/2008.- Otegi sale de prisión tras cumplir la condena por el homenaje a "Argala".

12/1/2009.- El TSJPV archiva la causa abierta entre otros a Otegi, al actual lehendakari, Patxi López (PSE), y a su antecesor, Juan José Ibarretxe (PNV), por reunirse en 2006 y 2007.

9/10/2009.- El juez Eloy Velasco abre juicio oral a Otegi por enaltecimiento del terrorismo en relación con su intervención en el acto celebrado por Batasuna en el velódromo de Anoeta el 14 de noviembre de 2004. La vista comenzará el próximo jueves.

13/10/2009.- Detenido en Guipúzcoa junto a otros dirigentes de la izquierda abertzale acusados de intentar reconstituir la dirección de Batasuna. Tres días después, el juez Baltasar Garzón ordena su ingreso en prisión incondicional, situación en la que permanece hasta hoy.

2/3/2010.- La Audiencia Nacional le condena a dos años de prisión por enaltecimiento del terrorismo durante su participación en 2005 en Amorebieta (Vizcaya) en un homenaje al preso etarra José María Sagarduy.